江西省呼吸疾病重点实验室成立于2012年，依托国家重点学科呼吸科，成立以来一直专注于呼吸疾病相关的研究工作。2020年依托“呼吸疑难病症诊治能力提升工程”项目，研究所迁至象湖院区，以全新的环境、先进的设备为江西省的呼吸疾病研究工作开启新的篇章。

江西省呼吸疾病重点实验室目前由分子生物学实验室、细胞生物学实验室、病原微生物实验室、呼吸免疫以及肺癌早筛早诊实验室以及分析测试中心组成：

细胞与分子生物学平台

细胞与分子生物学平台可提供细胞培养、细胞功能测定以及各种分子生物学相关实验的硬件及技术支持，主要内容包括原代细胞提取和细胞株传代培养；细胞的冻存和复苏；细胞转染与鉴定；细胞的运动、增殖、分化、凋亡等细胞行为学检测；核酸的提取、纯化及测定，DNA体外重组，RNA分析，蛋白质分析（如蛋白质浓度的测定、聚丙烯酰胺凝胶电泳、蛋白质免疫印迹杂交技术、蛋白质双向凝胶电泳、酶联免疫吸附法等）。

细胞与分子生物学平台现有主要仪器设备包括：实时荧光定量PCR仪、流式细胞计数仪、激光共聚焦显微镜、倒置显微镜、全自动免疫印迹仪、酶标仪、凝胶成像分析系统、超微量紫外分光光度计、大容量超高速离心机、细胞培养箱、水平电泳槽、小型垂直电泳槽、小型湿转电泳槽、振荡摇床、高压灭菌锅、二级生物安全柜、超净工作台、超低温冰箱、超纯水系统、细胞破碎仪等。

分析与测序平台

  分析与测序平台目前配置多种Agilent Technologies Inc.色谱质谱仪，包括1290 Infinity II -Ultivo液质联用仪、1290 Infinity II-6545液质联用仪、7890B-5977B气质联用仪、1290 Infinity II 液相色谱仪。能够开展生物小分子、大分子，天然产物有效成分，药物有效成分、环境污染物等定性及定量分析；代谢组学、脂质组学及蛋白组学研究。

分析与测序平台配备illumina MiseqDx system二代高通量基因测序仪，具有通量高、速度快、数据精准、性能稳定、操作简单等诸多优势，具备极强的临床和学术应用延展性，可实现全基因组、外显子组、转录组和单细胞测序。

病理分析平台

病理分析平台拥有全套先进的病理切片制作和图像分析设备（如电子旋转组织切片机、冷冻切片机、全封闭全自动组织脱水机、组织包埋机、正置显微镜、图像采集仪），由专人负责常规石蜡切片或冰冻切片的制作，可根据需要进行常规HE染色、特殊染色、免疫组织化学染色或相关的技术服务和指导，并可对染色后的切片进行图像分析和采集，出具直观、准确、科学严谨的病理分析报告。

微生物研究平台

微生物研究平台为拥有独立微生物实验室的生物II级实验室，配备微生物研究所需的基础仪器设备，包括超净工作台、生物安全柜、生化培养箱、生物显微镜、大容量高速冷冻离心机、冷冻干燥机、高压灭菌锅、菌落计数器等。

微生物研究平台与分子生物学平台联合，可进行多种病原微生物形态、分类、生理、生态、发育和遗传的研究，如微生物的结构与功能蛋白，真菌遗传、育种，真菌次级代谢，病原体和宿主对感染应答的基础，微生物高效表达系统和重组技术等。

现有固定专职科研工作人员15人，大部分都是近两年引进的国内外高水平研究机构的青年人才，其中具有博士学历10人，硕士学历3人，具有高级职称5人，中级职称5人，研究人员年龄层次以中青年为主。享受国务院特殊津贴1人，江西省“创新创业”高层次人才2人，南昌大学香樟俊才1人，赣江学者特聘教授1名，赣江青年学者1名。为加强人才队伍建设及国际学术交流，向国内外引进了三名高水平客座教授：2016年度特聘请美国哈佛大学医学院Morton教授为本研究所客座教授；2018年引进北京大学人民医院高占成教授为研究所客座教授；2020年引进“国家高层次人才”中山大学肿瘤研究所邹鸿志教授为研究所客座教授。

截止2021年，江西省呼吸疾病重点实验室共承担各级各类科研项目达40项，科研经费近800余万元。2017年研究所所长、重点实验室主任张伟教授主持申请的“呼吸疑难病症诊治能力提升工程”项目落地，研究所获得国家发改委直接经费以及配套资金6000万元，主要用于研究所的平台建设和人才引进。

主要研究方向： 

※肺癌的机制研究及临床诊疗

以肺癌的发病机制和影响因素为研究思路，以现代生物医学研究技术为主要手段，着重解决肺癌临床诊治过程中的问题。首先是肺癌的早期诊断的生物标记物的寻找；其次是挖掘肺癌发生发展以及转移的新的驱动基因，为新型药物研发提供更多的药物靶点；最后，探索药物治疗过程中产生的耐药机制，提高现有药物的治疗效率；最终，为肺癌的治疗提供更为广泛的思路和选择。 

※慢性呼吸系统疾病研究

针对肺纤维化、慢阻肺、哮喘等慢性呼吸道疾病，着重从慢性呼吸系统疾病的免疫，气道的结构重塑，细胞的损伤及修复方面去探究慢性呼吸性疾病的发生和发展机制，同时结合干细胞治疗等生物治疗技术，为慢性呼吸性疾病的治疗提供理论和治疗依据。

※微生态学和感染免疫学研究

采用分子生态学、细胞微生物学、基因组学、蛋白质组学和代谢组学等技术探索微生物与宿主相互作用机制、微生态失衡与机体免疫和感染的关系，研究微生物与宿主之间的互动关系，并从微生物及宿主功能基因、蛋白质及其代谢物的角度，整体研究机体感染、细菌耐药与微生态变化的关系，揭示微生物感染与清除的免疫机制。探索在感染的病理生理情况下微生物代谢、功能基因表达及致病性的变化。将现代生物学技术应用于微生态与人类感染性疾病的关系研究领域，使我国在这一科学领域处于国际领先地位，建立一系列有效预防及治疗感染性、传染性疾病的新理论及新方法。

※药物分析及研发

利用液相质谱联用、酶活性分析、代谢组学、蛋白组学等技术分析药物的作用与机体的效应，结合现代医学技术，针对呼吸性疾病的生物学和医学特征，结合现有的疾病研究基础和临床数据，运用蛋白质结构药理学等手段，筛选并开发有效的治疗药物（包括中药和西药），为临床用药提供新选择和病人的治疗提供新的希望。